最为著名的胡夫金字塔中也没有发现法老胡夫的木乃伊，虽然在大金字塔中发现了一块刻有胡夫执政第十七年的石块，但自从9世纪人们开始进入胡夫金字塔以来，一直没有发现胡夫的木乃伊，金字塔内有一具石棺，里面却是空的，考古学家对此一直不思不得其解。1993年，德国考古学家鲁道夫·甘登贝林曾操纵一台小型机器人对胡夫金字塔进行控秘，却在一条狭窄的甬道上被一扇石门挡住，2002年9月17日，由美国国家地理学会组织的考古学家再次借助机器人“金字塔漫游者”对胡夫金字塔进行探索，机器人绕过了那道石门，却仍然没有发现胡夫的木乃伊，令世人再次失望，也更加疑惑。
事实上，现在广为人知的图坦卡蒙木乃伊、拉蒙西斯木乃伊等都不是在金字塔中发现的，而是发掘于底比斯遗址附近的一处狭长的石灰岩山谷——“帝王谷”，一些不太有名的木乃伊也往往从金字塔附近的墓穴中发掘出来，甚至有一些就埋在沙漠中。
由此，人们不断怀疑修建金字塔的真正目的。有人认为金字塔并非古埃及法老的陵墓，而是古埃及人观察天象的参照和对天狼星崇拜的体现。现代天文学研究发现，古埃及的金字塔群与天空的星座之间有着密切的难应关系，尤其是吉萨高地上的三座金字塔，更具有重要的星象学意义，其中胡夫金字塔的南通风孔道在特定的时期直接对准天狼星，而天狼星位于猎户座和海尔波普慧星左面大犬座，是人类用肉眼能看到的最亮的恒星，在星象观测中可以起到导航的作用。古埃及人很早就已经发现，每当天狼星在黎明时刻出现在东南方的地平线上时，尼罗河讯期就很快要到来了，他们必须要做好迎接汛期的准备，天狼星因此得到古埃及人民的无比崇拜。
虽然人们认为其中一个厅室是法老的殡室，但没有在其中发现木乃伊。然而问题也就接踵而来，如果金字塔真是古埃及人民观察天象的参照，何必要耗费如此巨大的人力物力修建的如此宏伟壮观呢？同时根据阿布辛贝神庙、卡尔纳克神庙来看，古埃及人崇拜多神教，神牛、太阳、风、水等都是他们崇拜的对象，而其主神为阿蒙或者太阳神，天狼星只不过他们众多崇拜对象中的一个，并没有压倒其它诸神的地位，不可能单纯为了表示对天象的崇拜历尽千年不停的修建如此众多的金字塔。
