关于解放军在金门战役战术上的失误，刘亚洲说，传统的渡海作战，有两条原则必须遵循：一、第一攻击波要具有突破防线并向纵深发展的充裕力量，对渡海工具要求甚高;二、建立稳固的滩头阵地。金门之败，就败在这两条，尤其是渡海工具。当时，蒋介石下令，派空军将大陆沿海的船只全部炸毁。台湾飞机不光炸福建的船只，连浙江、江苏沿海的都炸了，甚至炸了上海造船厂。解放军第一梯队3个团9000余人登陆之后，第二梯队、第三梯队隔海待命，眼巴巴地盼望第一梯队的船回来，可因潮汐之故，船在金门搁浅，随即被敌军全部炸沉。而第一梯队渡海之后，并无师级首长统一指挥，3个团各自为战，朝纵深猛插，没有立即修筑工事，巩固滩头阵地，结果被国民党军队击溃。刘亚洲认为，一旦“台独”势力宣布台湾独立继而发生台海战事，我军要对台作战，第一梯队登岛人数必须在30万以上，与台军总兵力大体相当，否则不足以制敌。而且，将来我军攻台，台必攻我。纵是本岛作战，台军也必取攻势。我军必须做好与台军对攻之准备。
刘亚洲说，金门之战对我军而言，另一个没有想到的因素是武器──坦克。金门岛上有一支装甲部队，共有美制M5A坦克22辆。我军指挥员都知道这个情况。但我军历来对蒋军坦克十分轻视，加之这支装甲部队始组建不久，主要成员都是从淮海战场双堆集突围逃出来的残兵败将，哪敢言勇?我登陆部队并未认真准备反坦克作战。
金门战役失利原因很多，但刘亚洲认为，对于战争中突然出现的意外情况，要给予特别重视。他说：“将来我军一旦对台作战，务必做好第三股力量以突如其来的形式介入的准备。这第三股力量可能是日本，主要是美国。”
刘亚洲断言：一旦台海战争爆发，美国必然参战。理由有四：一是21世纪美国已把遏制中国的崛起当做首选目标;二是台湾具有美国和日本不可不看重的地缘和政治条件;三是美国对台湾安全的承诺;四是美国人的价值观念使然，它如不干涉别国主权，它就不是美国。他说，我们应从美国人那里学会“枪杆子里面出主权”的道理。主权不能用嘴巴来保卫，只能用武力。
尽管刘亚洲对金门战役的检讨在军中和社会上也有争议，但大多数人认为，刘亚洲痛定思痛，重新反思这场战役，通过反思和总结教训，无疑为将来可能发生的对台作战提供了新思维。
2002年1月，刘亚洲调任成都军区空军政委，第二年底升任中国人民解放军空军副政委，2004年晋升为中将。
