听闻此讯，蒋经国痛心疾首，流涕向父亲检讨。蒋介石暴跳如雷，连连斥责儿子“无能”，“用人失策”;他指示国防部火速调兵遣将，对起义者围追堵截，并悬赏银元5万，购买贾亦斌的头颅。
国民党当局随即调集了数个师及浙、苏、皖地区好几个县的保安队警察，甚至动用了守卫长江的精锐和空军，对起义部队层层包围，以图迅速扑灭这燃起在国民党心脏地带的起义之火。
由于起义是被迫仓促爆发的，而且一开始就发生了意外，在东大营的作战中既暴露了起义，又耽搁了时间。没能按预定设想，在敌人毫无察觉的情况下迅速跨越京杭国道，跳出敌人的围堵。
起义部队刚刚进入距嘉兴30里的乌镇，就陷入了国民党军的包围。贾亦斌根据形势，将部队分兵三路突围。他自率第一路;刘异率第二路;李恺寅率第三路。
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经过激战，三路起义军都突出了乌镇，但作战减员严重，原3000多人还剩2500人;黎天铎等反对起义的军官，也在战乱中逃脱。围堵起义部队的国民党军越聚越多，起义者在向莫干山的推进中，每走一步都要付出极大的代价。
4月10日，刘异率领的第二路军，打到了距莫干山15里的三桥埠，随后乘夜色冲破敌军封锁，进入莫干山。由于连日作战，极其疲惫，许多人一进山就倒地入梦。
国民党浙江省武康县县长兼莫干山管理局局长王正谊，假装对起义表示同情，张罗膳食住宿，稳住刘异及部队;暗中却派人下山，通报国民党驻军赵荡辉部。赵立即部署围歼，于11日拂晓发动突袭，使第二路军在措手不及中被缴械。
当贾亦斌所率的第一路和李恺寅所率的第三路汇合时，战斗人员只剩下三百多了。靠这些人硬闯京杭国道，显然是以卵击石;且眼前的吴兴县城，又是敌人的防守重点。贾亦斌等决定：冒充国民党第36师一部，以追击“叛军”为名，智过京杭国道。
吴兴城的保安团和警察，做梦也没想到起义部队敢从他们这重点防卫环节穿过。起义部队大摇大摆地走进保安团和警察的防线，缴了他们的械，顺利通过了京杭国道封锁线。
4月12日，贾亦斌率部来到妙西山良村。这里已是山区，放眼望去，群山叠嶂，起义者们无不以为进入了安全地带。5天了，他们一直在数以万计的敌丛中，且战且走，几乎支撑不住了。可他们在小憩中还未稍得调整，密集枪炮突然铺天盖地而来。
一夜鏖兵，只有八十余人冲出了良村。他们这才认清，即便是在山区，依然险情四伏。为了使这最后的八十余人尽量多地跳出敌人的罗网，贾亦斌决定化整为零，扮装成老百姓，分散突围。
为了松懈敌人，便于突围，他们散布了贾亦斌已战死的消息。国民党当局出于宣传目的，在各报以大幅标题刊发“贾亦斌在良村被击毙”消息，结果贾亦斌妻子看到这一报道，如闻晴天霹雳，悲痛欲绝。
分散突围后，贾亦斌历经辗转，终于在临近4月下旬时，在浙江、安徽交界处，同中共游击队接上了联系，见到了中共苏浙皖边区工委书记兼游击队政委钱敏。此刻，他再也支撑不住十多天操心、奔波和苦战熬煎，一下子病倒了。
