但赵秉钧拒不到庭，而是躲进了一家法国医院。
接替陆徵祥担任内阁总理后，赵秉钧对袁世凯一直是绝对服从，甚至在国会通过自己的总理任命后，干脆将国务会议移到总统府，这样，国务院形式上虽有会议，但实权已完全操于总统府。赵秉钧对“所有院(国务院)中纸片公文，概不披阅，一切文件直接总统办理”。即使偶尔提笔，也仅仅信手署名，以“总统阅过盖印，必不错误”。内阁总理完全成了大总统的办事员。
宋教仁遇刺后，赵秉钧刚刚替袁世凯完成了“善后大借款”，举国愤然，将两件事的矛头直接指向赵秉钧。
袁世凯为了平息众怒，接受了赵秉钧的辞职，转而指定段祺瑞代理内阁总理。
由于洪、赵二人拒不到庭，“宋案”的司法程序很难再走下去。而在南方的孙中山先生一开始对司法程序解决“宋案”持反对态度，在“宋案”司法程序开始之际，他就四处联络，准备搞“二次革命”，武力讨袁。袁世凯也不是省油的灯，一面通过“善后大借款”搞来的钱扩充军备，一面拉拢各派势力。
很快，“二次革命”爆发，孙中山的军队不堪一击，孙黄流亡海外。袁世凯派人查了查孙中山任职的铁道公司，发现一寸铁路未建，而浪费公帑百十万两，随即以这个名义通缉孙中山。
这之后，孙中山忙着在海外重建中华革命党，要求党员打指模、发毒誓效忠领袖。袁世凯则在北京忙着解散国民党、瘫痪国会，进而走向洪宪皇帝的宝座。
而喋血上海车站、以生命扞卫共和体制的宋教仁，很快被人所遗忘。曾经轰动一时的“宋案”，也没有了说法。
