年羹尧也算争气。经过充分的作战准备，在雍正二年(1724年)初，年羹尧下令诸将“分道深入，捣其巢穴”。在短短的半个月内，各路大军跃进千里，将叛军打得落花流水，稀里哗啦。特别是四川提督岳钟琪(当时雍正封其为奋威将军)更是表现神勇，他率军一路狂追，直捣敌穴，匪首罗卜藏丹津仓皇之下，化装成女人才得以逃脱。最后，罗卜藏丹津领着两百多残兵败将投奔了准葛尔部的策妄阿拉布坦，从此一蹶不振。
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由此，“年大将军”之威名，大江南北，人尽皆知。
对于年羹尧的功劳(不仅仅是战功，关键还是对雍正初期稳固其皇位的贡献)，雍正是看在眼里的。他曾极为肉麻的对年羹尧说：“朕实不知如何疼你，方有颜对天地神明也。西宁危急之时，即一折一字恐朕心烦惊骇，委屈设法，间以闲字，尔此等用心爱我处，朕皆体得。总之你待朕之意，朕全晓得就是矣。所以你此一番心，感邀上苍，如是应朕，方知我君臣非泛泛无因而来者也，朕实庆幸之至。”
雍正对此时的年羹尧可谓是圣眷正浓，几乎有过火之嫌。譬如有一次赐给年羹尧荔枝，为了保证新鲜，雍正特令驿站必须在六日内快马送到(从京师到西安)，这难免让人想起当年唐明皇的“红尘一骑妃子笑”的典故。至于其他的赏赐，如奇宝珍玩、珍馐美味那更是隔三差五的就送到年羹尧的军中。除此之外，年羹尧的家人有什么事情，雍正也是关怀备至，嘘寒问暖，连年羹尧的妹妹年贵妃和外甥福惠(8岁夭折)的身体状况，雍正也常常在下发给年羹尧的手谕中特意告知。
是否难辨：年羹尧
雍正曾语重心长的跟年羹尧说：“朕要是不做一个出色的皇帝，就对不起你如此对朕;但你要是不做英武超群的大臣，那也不能回报朕对你的知遇之恩。但愿我们两个能给后人做千古榜样。”他还常念叨说，如果朝中要有多几个像年羹尧这样的大臣的话，那大清帝国还愁不强大?年羹尧听雍正这么推心置腹，那还不云里雾里，喜不自禁?
