受极左思潮的影响，在“以阶级斗争为纲”的时代，缅怀、纪念国民党屠杀的革命先烈成为热潮，日本战犯来南京也都被组织去雨花台给共产党员默哀(而不是组织他们到各个屠杀点遗址去向死难者默哀。——楼主点评)。
受日本篡改历史的刺激
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尽管如此，还是有人站了出来。 南京大学历史系老师高兴祖是新中国成立期间关于南京大屠杀研究的第一人。 1960年，高兴祖等4位南京大学老师带着7名学生在南京大学及周边的人群中进行调查。 1962年，高兴祖完成了书稿 《日本帝国主义在南京的大屠杀》，这也是新中国研究南京大屠杀最早的书稿。但是直到1979年3月，才从油印本变成了白皮书，是内部出版物。
直到1982年，日本文部省审定的教科书对日本历次侵华战争的史实进行了多处篡改，把对中国的侵略改为“进入”，并对南京大屠杀等历史事实进行淡化或删改。在日本篡改教科书的刺激下，中国学者在申报科研课题时正式提出了对南京大屠杀进行研究。1983年，第一次提出了修建南京大屠杀遇难同胞纪念馆。1984年开始筹建，距离新中国成立35年时间。 1985年抗战胜利40周年，南京大屠杀遇难同胞纪念馆建成开馆，爱国主义教育焦点告别了雨花台。
南京大屠杀纪念馆馆长朱成山带有深意地说“没有日本否定历史，就没有南京大屠杀纪念馆。”
