1960年，当工程热火朝天进行的时候，中苏由于意识形态分歧的原因关系逐渐恶化。苏联政府单方面决定撤走全部在华专家，停止设备供应，撕毁了合同。
1961年2月，由海军、国务院有关部委和总参通信兵部人员组成了超长波台建设委员会。值得一提的是，周恩来总理一直关心超长波电台的进展情况，他亲自选调精兵强将，让国务院建筑工程部设计院承担土建设计，中央广播事业局设备制造厂承担天线铁塔加工和架设，海军承担技术工艺、安装调试和地网的设计，以集体转业的一个志愿军师为主体组建的第4工程公司承担土建任务。
时任国务院副总理的罗瑞卿专门听取了工程建设的情况汇报。海军专门召开建委会，大家争先恐后踊跃发言，发言集中到一点：不管遇到多大的困难，工程只能上不能下，中国人民有能力把这项工程建设好，要为中国人民争口气，要维护中华民族的尊严。于是，所有参建人员怀着强烈的民族自尊心，奋发图强，艰苦创业，依靠自己的智慧和双手，边设计，边施工，边安装，边调试，使各项任务按计划顺利实施。
当时正值3年自然灾害时期，物资奇缺、生活条件困难时刻考验着全体建设者。比如，机房屏蔽层和地网系统需铜材150吨（当时铜材是依靠进口的），铁塔拉线接头铸钢加工需要豆油3吨，都是经国家计委特批解决的。那时粮食定量很低，每人每月10多公斤，副食品基本没有，每顿饭每人只分到两个黑面馒头或两个玉米面窝头和一碗菜汤，食不果腹，不少同志身体浮肿，但为了保证“争气工程”的顺利进行，大家发扬艰苦奋斗精神，挖野菜，掏老鼠粮，组织人员开荒种地，搞农副业生产，想尽一切办法渡过难关。
1964年4月的一天，正当安装工程紧锣密鼓进行之时，邓小平等中央领导来到施工现场视察。他指示要自力更生，克服困难，把工程建好。同年7月，全国人大副委员长郭沫若也来到工地视察，并题词：“在技术上要赶上和超过世界先进水平”。中央首长的视察和指示给全体参建人员以极大的鼓舞，1965年9月，工程的安装和调试任务顺利结束，11月进行了首次对潜通信试验，试验证明各项指标达到设计要求，效果良好。1966年2月，超长波电台正式参加通信执勤任务，电波传遍了五洲大洋，向全世界庄严宣告：新中国的第一座大型超长波电台诞生了！
