三下江南受批评
1947年1月，北满我军为打破国民党军“先南后北，南攻北守”的战略企图，积极配合南满作战，冒着零下30多度的严寒，发起了“三下江南”战役。359旅除留718团继续剿匪外，主力乘火车南下至三岔河、陶赖昭一线集结。一下江南中，359旅未直接参加作战，渡江后只在德惠以东担负监视和破坏敌工事任务。1月19日，奉命返回江北三岔河，改编为独立第1师，师长刘转连（5月由副师长贺庆积接任），政委晏福生，所属第1、2、3团由原717、718、719团依次改称。2月21日，独立1师参加二下江南，于25日晨攻克敌保安9团（欠第1营）据守的步海车站，毙伤俘敌561人。
3月8日，我军为反击过江北犯之敌，发起第三次渡江作战。独立1师任务为佯攻靠山屯与切断敌71军87师撤回农安的退路，以便我主力歼灭该敌，并负责查明靠山屯敌情。该师主力于9日拂晓进至靠山屯以东之拉马营子、老边岗一线。此时敌人已由五家站向靠山屯方向撤退，为保证安全，8时，敌由靠山屯后岭派出约1个营的兵力，在炮火掩护下，向拉马营子我1团2营阵地发起攻击。该营进行反击，并攻入靠山屯一角，后因腹背受敌又撤了出来，即与敌形成对峙，敌主力趁机加快回撤步伐。独立1师虽发现敌人撤退迹象，但却被少数攻击之敌迷惑，未按照9日东总电示“以一个营抗击，主力从敌侧背打出去”的战法执行。白天机会已失，夜间又无积极行动，致使当面之敌87师撤走时仍未发觉。这与2纵5师在靠山屯积极主动寻敌、歼敌、调敌形成了鲜明的对比。
10日凌晨，2纵5师搜索靠山屯，发现敌88师一部千余人尚未撤走，即停止东进，展开进攻，当日24时胜利结束战斗。靠山屯之敌被围后，敌71军急调87、88师由农安、德惠来援。东总抓住有利时机，当即决定改变原定歼中长路东大房身之敌新1军5个团的部署，以一部兵力佯攻，将主力1、2、6纵等6、7个师西移靠山屯西南地区，寻机歼灭敌71军主力。11日，敌87师由万金塔已进至苇子沟、篙子站地区，企图增援靠山屯。靠山屯守军被歼后，该师见势不妙，急忙分两路向农安方向撤退。独立1师接东总电令：“进至靠山屯西南之敌第87师，今明两日必然向农安逃跑，令独立第1师应不怕疲劳，不怕飞机，向农安追击，并于12日拂晓前，赶到农安近郊，截击敌人，途中遇敌即应猛打，不必等待友军。”该师于16时由靠山屯后岭出发，当先头第3团进抵苇子沟时，即与向农安撤退之敌87师遭遇。但第3团各营连明知敌人撤退，却不大胆出击。1营1连与敌并行数百米，副营长王福生竟未敢下令截击，就将部队撤离公路。2营5连与敌相遇，尾追5里返回。更严重的是，当敌人已乘隙全部脱逃时，师、团均未组织积极追击，而在苇子沟、东西小城子一线停止前进，眼睁睁地将敌87师放走。独立1师不执行东总命令，未能完成任务，严重影响了战局，林彪非常生气：“独1师怎么搞的，这哪像个主力部队？”立即通报全军予以严厉批评。
12日，我军主力在德惠、农安之间的郭家屯、王家车铺等地，将敌88师全部、87师一部以及71军特务团、工兵营等敌堵住，全歼6500余人。13日，独立1师逼近农安。14日，又未执行向农安以南马家店方向派出一个营侦察的命令。此时，敌新6军22师和13军54师来援农安，形势对我不利。16日，东总命令各部撤出战斗，回师江北。
三下江南结束后，独立1师于3月23日在江北之水立屯召开军政扩大会议，认真检讨了苇子沟战斗教训，并从上到下整顿了战斗作风，对畏缩怕死、作战不积极的干部坚决进行了处理，同时又进行了战术教育。经过整顿，全师人员决心今后一定打好仗，挽回359旅的声誉。5月，独立1师参加夏季攻势，在攻打长春飞机场的战斗中，打得英勇顽强，但伤亡也很大。东总表扬该师“战斗作风较前大有进步”。
因为独立1师三下江南作战表现不佳，当时东总编制的“东北民主联军主力兵团发展简历表”中，对其评价为：“该师是北满部队中有老基础的部队，战斗力尚未充分发扬，在运动战中表现不积极。”甚至到了1949年10月，东北军区司令部编写《东北三年解放战争军事资料》时，仍毫不客气地指出：“该师系东北各部队中历史基础最老的部队之一，其中有不少为土地革命及抗日战争时期之骨干成分，连以上干部绝大多数为关内参军之老干部，部队作风甚疲塌，缺乏朝气，保守性大，进步慢，战斗作风被动，战斗力未能充分发挥，其部队历史应列入东北各部队中之主力师，但战斗力还不如一般老部队及赶不上进步较快之新部队。”
