1985年2月，3500名人民解放军分兵两路包围朱巴城。当地政府军和民兵防卫坚固。人民解放军屡攻不克。加朗果断改变策略，趁苏丹政府军全力援救朱巴后方空虚之机，率部下乘着丰田卡车，机动突袭了政府军约博马和伊罗勒。两地的政府军千余人被全歼，损失巨大。
此事惊动了喀土穆，尼迈里因这此失败下野。
南方人民解放军趁北方政治混乱之机。加剧攻势。夺下了更多的政府军据点，所有躲在据点内的政府军都被分割歼灭。1985年4月14日，一架政府军的水牛型运输机被人民解放军击落，机上4名飞行员丧生。
1985年7月起，利比亚的卡扎菲本着“同宗同教“的感情，来援助苏丹政府了。而人民解放军没有外界的支持，仍能独自击败政府军的围剿，而且越打越强。
1985年7月，人民解放军放出警告，因为苏丹政府用民航客机运送兵员，如果政府军继续这一行径，人民解放军不得不将民航客机作为打击目标。1986年8月16日，人民解放军将警告付诸实施，用从政府军手中缴获的萨姆-7导弹击落一架苏丹民航客机，机上70人无一生还。
1985年底。苏丹政府做了一个错误的决定，他们向南方的认为是亲政府的部落放发包括中国“56冲“，俄罗斯AK-47等在内的大量武器。想实施南方人打南方人的政策。结果这搬起石头砸了自已的脚。南方部落拿到武器后就加入人民解放军。苏丹政府花巨资购买的武器反过来装备了自己的敌人。
1986年，政府军主力集中起来，准备在1986年开年向人民解放军发动大规模攻势。不料，人民解放军先发制人发起攻势，消灭了阿多克地区的政府军，随后他们又重创了朱巴的政府军。
利比亚见政府军屡战屡败，便希望苏丹与人民解放军达成停火。4月4日，政府军一架水牛型运输机在人民解放军司令部博尔地区被击落。机上的16名遇难者中有7人是政府负责与人民解放军官员。这一事件让调解努力彻底失败。
之后，人民解放军打下了瓦乌市。
1986年11月，屡败屡挫的政府军集中5000人的兵力，配以大量的坦克和装甲车，发起大规模攻势。却又一次败在加朗的人民解放军手下。损失数百人，十多辆T-55坦克和装甲车被击毁。
1987年年初，双方围绕着瓦乌重组兵力，准备再次展开决战。5月11日，一架政府军C-130运输机被人民解放军的萨姆-7地对空导弹击落，机组5人全部遇难。机上的军用物资被人民解放军缴获。
由于连战皆捷，到1987年人民解放军的兵力已达22000人。
二，苏丹向中国引进歼七战斗机，扭转战局
1989年，巴希尔军政府军上台。他主张在苏丹施行比尼迈里更加极端的宗教主义。
这时，苏丹政府军也不甘心失败，从中国购买了12架歼-7战斗机，从利比亚讨来了12架米格-23战斗轰炸机，苏丹政府军空军还将老的8架米格-21战斗机从单座改造成双座，以适应于对地攻击。
1988年初，人民解放军发起代号为“光明之星“的大规模进攻。苏丹政府军顽强抵抗，还匆忙将从利比亚援助的米格-23战斗轰炸机投入作战。仍不能抵抗人民解放军的攻势，朱巴、瓦乌、托里特尔、马拉卡尔、本秋、乌瓦勒、伦拜克、亚勒、纳赛尔、阿库巴、耶伊、博尔马里迪、穆那德里等南方各座城镇均陷入人民解放军之手。到了7月，加朗宣布，整个南方已被人民解放军解放。此时南方人民解放军已有44000多人。
在“光明之星“行动中，政府军有3架米格-23被人民解放军击落，还有3架因事故坠毁。政府军损失的其它飞机有：3架F-5战斗机，2架水牛运输机，2架C-130运输机，一架歼-6战斗机，一架米-8直升机，一架安-24运输机，一架歼-七。
这是第一次有歼七战斗机被击落。此后短短一个月内，歼-七又被击落2架
到了1991年，苏丹巴希尔政府得到了伊朗和利比亚这些伊-斯-兰反美国家的支持，而苏丹南方人民解放军得到了肯尼亚和乌干达、埃塞俄比亚这些基-督-教国家的支持。黑非洲各国都将加朗视为顶住苏丹伊-斯-兰革命风暴的支柱。
巴希尔在以往的历次战争失败中引取了教训，采取了三大措施：
一是整顿军队内部，加强宗教极权。
1991年4月中旬，巴希尔政府宣布粉碎一次政变，20名军官被处决。8月中旬，国民党、民主联合党等一批主张伊-斯-兰世俗化的军官准备政变，计划立即处决巴希尔和宗教领导人图拉比，宣布取消国家伊-斯-兰法。推行面向阿拉伯国家的外交政策。结果被侦破，8月20日，包括10名现役军官、一批退役军官和前教育部长巴克里＊阿代尔，民主联合党领导成员前卫生部长艾哈迈德＊巴希尔等人被逮捕。
