这场大屠杀持续了两个月，从天京城门推出来的太平天国文武官员、将士等两万多具尸骸，顺江而下，把长江染得赤红。
整座天京城变成一个恐怖的死亡世界。
就在这场屠杀开始的时候，石达开回到天京，他要求洪秀全立即制止韦昌辉的行为。意想不到的是，洪秀全竟然拒绝了他。为什么呢？因为洪秀全是在利用韦昌辉。
《石达开自述》中说：“故意加封杨秀清为万岁，激韦昌辉动手。总之利用杨秀清和韦昌辉的矛盾借刀杀人，杀死杨秀清和东王阖府，甚至使用圣旨诱杀杨秀清余部。”
如果是这样，韦昌辉设苦肉计诱杀五千将士的行动，是得到洪秀全认可的，那条杖责他和秦日纲的诏令，并非是假传，而是出自洪秀全手谕。
石达开显然没有料到这一点，他以为洪秀全会支持自己，所以没带兵就进城了。可是当他和韦昌辉都见面后，他才发现自己的处境危险，连忙跳城逃走。
石达开出城后，要求洪秀全诛杀韦昌辉以谢国人，可洪秀全拒绝了他的要求。与此同时，以“反顾偏心罪”悬赏捉拿石达开的天王诏旨却传遍天国各地。
现在我们知道了，韦昌辉在这场血腥屠杀中，只是个报私仇兼夺权的执行者，洪秀全才是真正的元凶。他对付石达开与诛灭杨秀清的手段如出一辙——他想利用自己的圣旨加上韦昌辉的势力，一举除去石达开。
可以想见，假如石达开真的被谁取了首级去领赏，洪秀全一定会把杀石达开的责任和杀杨秀清的责任一样推给韦昌辉，说自己是在韦昌辉的胁迫下下旨杀石达开的。于是石达开的“英灵”将为他顺理成章地诛杀韦昌辉作最后一次贡献。之后，洪秀全为了表示自己不忘功臣功绩，大约也会照杨秀清之例办理，把自己的某个儿子过继给石达开，再弄个“翼升节”什么的。于是乎，大家都会说天王英明，翼王可惜。
然而，石达开在天国军民中的极高威望，是洪秀全没料到的。举国军民拿着捉拿悬赏的圣旨当草纸，各地军队纷纷支持石达开举靖难之旗。当宁国告急，石达开暂缓讨伐韦昌辉，先退清兵之时，他的威望已经达到最高点。而也就在石达开开赴宁国援助陈玉成的前后，向天京方面发出通牒，再次公开要求杀韦昌辉以顺民心，并声称如若不然，将提靖难之师打回天京以清君侧。
眼见借韦昌辉杀石达开的计策落空，洪秀全只得清理门户，表现一下自己的“正义的姿态”。
夏历十月初五，洪秀全亲自带兵，借城外翼王大军的声势，向乱党韦昌辉发起进攻，韦昌辉根本无力抵抗，到了最后，死命追随他的人员只有200余人。这些也被全部杀死，韦昌辉被活捉。他的父亲韦元玠及全家老小全部被杀，只有他的弟弟韦俊此时在武昌与清军作战得以幸免，而后，韦俊投降了清军。
韦昌辉被活捉后，天王下令将他五马分尸，并割下他的首级送到翼王石达开的军中，以接石达开回京。为了一泄天国军民的愤怒，天王再次下令：将韦昌辉的尸体剁成肉块，每块两寸见方。悬挂在天京城内格栅示众，上面标明：“北奸肉，只准看，不准取。”
可谁是幕后真正最奸的黑手呢？答案我们已经知道了。
这场史称“天京事变”的太平天国叛乱虽然平息，巨大的损失却已无法弥补。咸丰三年，公元1853年6月，太平天国形势一片大好，然而，东王遭屠杀，韦昌辉被剁成肉块，成为太平天国迅速衰落的转折点。太平天国败于内讧，死于天王之手。
