血洗武汉南京大屠杀发生之后，参谋本部召回了松井石根以下犯事的军官，由俊六担任中国派遣军华中方面军司令官。相继发动了徐州会战和武汉会战。1938年10月，他指挥日军占领武汉后，在他的纵容和唆使下，南京大屠杀的惨象又发生了。
在江汉路海关前，日本兵抓住80余名中国居民，当场刺死几个，随后将其余的人推入江中用机枪扫射，鲜血顷刻染红了江面。大智门附近和华景街横七竖八地躺着无辜百姓的尸体。像南京大屠杀一样，杀人、强奸、抢劫、放火往往是同时进行的。汉口一位老商人带着亲眷到租界避难，日本兵在半道截住了他们，将老商人的头按在大石头上，用斧背砸断他的颈骨而致死，几个随往的女眷全被奸污，一个年轻妇女惨遭轮奸后被杀死，尸体被踢入河中。武昌下新河一个防空壕内躺着十几具被辱又被杀的裸体女尸。武汉特三区内发生过奸死孕妇的惨剧。在汉阳，日本兵从一名中国妇女的棉袄夹缝里搜出几张法币，不但抢走了法币，还挖掉这个妇女的眼睛、鼻子和乳房，砍断四肢，残酷地将她折磨死。放火的事件不断发生，民权路、民族路和襄河一带的民房被纵火烧成一片瓦砾。随处可见日本兵们手持刀斧，破门入户洗劫财物。中山路上所有的商店全部被日军霸占，他们还在大白天任意对行人搜身抢劫。
武汉街头，日军肆意用机枪扫射平民，奸淫残杀中国妇女的罪行更是每天都在发生。很多日军宪兵也当街大施淫威。花旗银行一名外国职员目睹此事后说：“这还是日军的宪兵，宪兵尚且如此，其他士兵还能不成为强盗吗？”
俊六不仅不制止其部下对手无寸铁的中国老百姓烧杀抢掠，甚至还纵容和支持他们的暴行。进驻武汉后，他立即下令开设了“汉口野战邮局”，让日本兵存汇赃款，大大助长了抢劫行为。该邮局局长向东京《朝日新闻》的记者透露，日军占领武汉的头一个月，不包括军官，仅日军士兵的存汇款即达到120多万日元，约合现在的30多亿日元。
