不料吏部尚书焦芳却在当天晚上向刘瑾透漏了消息。刘瑾大惊失色，连夜召集其他七人到明武宗面前哭诉求情。看到明武宗颇为所动，刘瑾趁机说，“害奴等者王岳。岳结阁臣欲制上出入，故先去所忌耳。且鹰犬何损万几。若司礼监得人，左班官安敢如是。”明武宗大怒，当夜下达命令，提拔刘瑾执掌司礼监，同时将王岳等人抓捕，发配充南京净军。
次日群臣正准备上奏，发觉有变，内阁首辅刘健被迫辞职，而向刘瑾报信的焦芳入阁。同时刘瑾还派人追杀已经被流放的王岳、范亨，将徐智的胳膊打断。刘瑾得势后，大肆报复，杖责贬谪朝中正直的大臣。王守仁就是在此时得罪了刘瑾，被杖四十，谪贬至贵州龙场当驿丞的。
刘瑾非常聪明，每次在皇帝玩得十分开心时才上前奏事，这自然让正德皇帝很不爽，说道“我用你干什么吃的，又来烦我？”从此刘瑾开始专决朝政。但是刘瑾文化程度并不高，所以每此批答章奏，都要带回自己的家里，与妹婿孙聪、张文冕参议决定，然后再交给焦芳润色。
1507年3月刘瑾召集群臣跪于金水桥南，宣布将刘健、王守仁等六十余人列入“奸党”。同时大肆迫害忠良，任用亲信，连刘瑾家奴才的女婿竟然做了山东学政（相当于山东省教育厅厅长）。朝中公侯勋戚，每此私下谒见刘瑾，都要跪拜。朝臣上奏都要写刘太监，一次都察院误写了瑾字，为了赔罪，都御史屠滽竟然率领手下向刘瑾下跪请罪。
刘瑾专权的事迹很多，不再一一叙述。1510年4月安化王朱寘鐇以讨伐刘瑾的名义起兵反叛，但很快就被讨平。而负责征讨的杨一清决定联合八虎之一的太监张永除掉刘瑾。趁正德皇帝设宴时，张永上奏“瑾不法十七事”。正德皇帝大怒，当夜下令捉拿刘瑾，囚禁于菜厂。
