瑶姬在重生之后，已不能重回天宫了。她生性活泼，不肯老老实实地待在姑瑶山上，就经常化身成各种形态在人间游走。她深切地关爱着人间的百姓，到处为人们排忧解难，救死扶伤。渐渐地，巫山上有神女的消息就流传了开来。人们都很感谢这位美丽善良的女神。
有一年，巴蜀遇到了历史上罕见的洪水。大禹开始受命治水。他一路凿山通河，来到巫山脚下，准备修渠泄洪，不承想触怒了一只在巫山上潜修了多年的蛤蟆精。这只蛤蟆就使用法术阻挠大禹开山。大禹措手不及，被打得人仰马翻，在当地人的指点下，他决定去向巫山神女瑶姬求助。
瑶姬敬佩大禹不求回报但求以利天下的精神，哀怜背井离乡、倾家荡产的灾民，就传授给大禹差神役鬼的法术，并赠给他一本能够防风治水的天书，帮助他制伏了蛤蟆精，止住了飓风。之后，瑶姬又派遣侍臣将巫山炸开一条峡道，令洪水经巫峡从巴蜀境内流出，涌入大江。饱受洪灾之苦的巴蜀人民终于获救了!神女关爱三峡人民，唯恐长江之水再度泛滥，遂化为神女峰，永驻三峡。
