关税会议是在全国人民的反对声中召开的。会议之前，1925年7月，中共北方区委和共青团北方区委联合发表了《告工农学生军士书》，提出了“关税自主”的口号。《向导》和《政治生活》发表了《关税会议与司法调查》、《我们对于关税问题的意见》、《关税会议与段祺瑞政府》、《关税会议与民众政权》、《帝国主义与关税会议》等文章，指出帝国主义企图借此会议来缓和中国人民的反帝国主义运动，而段祺瑞政府则企图垄断二五附加税；号召人民争取无条件的关税自主，并强调“在关税自主运动中，更不要忽视了民众政权的斗争。”
关税会议在北京开幕前一天，国民党北京市党部、学生联合会、反帝国主义大联盟等200多团体3000余人在天安门召开关税自主运动大会，会后游行，散发传单20余种。次日，关税会议开幕，北京各校沪案后援会、广东外交代表团等召集北京180余团体，130余大中学校2万余人举行示威游行，反对关税会议，力争关税自主。游行队伍散发传单100余种。11月3日，全国学生联合会总会在北京召开了全国临时代表大会，通过了《关税自主决议案》，要求关税会议只能讨论无条件地收回关税自主权，废除现行条约中关于关税之一切束缚的问题。5日，新闻界关税自主促成会举行成立大会并发表宣言。6日，北京各大学教授关税自主促成会成立，并自10日开始由马寅初等轮流在各校举行关税自主问题讲演。10日，北京全国学生联合会总会与广东外交代表团等发起成立关税自主示威运动筹备会，并于同日举行第一次示威运动，通电全国采取革命行动，打击帝国主义侵略，还向段祺瑞发出最后通牒，令其即日下野。11日，广东外交代表团召开北京各团体各大学代表联席会议，通过关税自主三项原则：一、“无条件地收回中国自定海关税率权”；二、“中国自行保管税款及中国自定税款用途”；三、“中国自雇用洋员应不基于国际协定之束缚”。13日，中国国民党发表《对关税会议宣言》，提出“此次会议当要求完全关税自主”，但国民对于北京政府不能信任，因此，“会议应有本党政府参列”。
关税会议于11月19日通过的以裁厘为条件的关税自主案，进一步暴露了帝国主义各国反对关税自主的真实意图。中国人民反对关税会议的斗争更加高涨。11月22日，国民党北京市党部、北京总工会、北京学生联合会等团体召开了关税自主国民示威运动大会，北京警厅派军警包围了各集合点，禁止集会游行，群众与军警搏斗，伤100余人，终于冲出包围，2万余人在天安门举行了集会，通过了关税自主决议案，要求绝对无条件地收回关税自主权；反对以裁厘为条件的关税自主案。同时还通过了“民众自由”决议案。会后举行了游行示威。
在此前后，反对关税会议的斗争迅速由北京扩展到全国各地。10月18日，上海市民8万余人在闸北举行市民大会，反对关税会议。会上散发传单数十种，会后举行示威游行。26日，天津关税自主运动市民大会在南开大学操场举行，有天津总工会、国民党天津市党部等50余团体及各学校参加。大会通过了通电全国反对关税会议和组织关税自主运动大同盟的决议。会后举行游行。31日，湖南学生联合会致电段祺瑞，指出其违背民意召集关税会议，又纵警捕殴爱国群众，全国公愤，要求“惩凶释囚，停止会议进行”。11月7日，武汉学生联合会，工学联合会等团体5万余人在武昌举行国民关税自主运动大会，通过了反对关税会议，要求关税自主通电，会后游行示威。
此外，南京、广州、重庆、长沙、郑州、芜湖等地群众也先后举行大会、示威游行，发表宣言或通电，反对关税会议。
反对关税会议的斗争，促进了以北京为中心的北方革命运动的进一步高涨。11月下旬在北京爆发了被称为“首都革命”的推翻段祺瑞政府的群众革命运动。
在反对关税会议的斗争中，段祺瑞政府的卖国嘴脸进一步暴露，广大人民群众对它十分痛恨。中共北方区委决定抓住当前有利时机，联合倾向革命的国民军，把群众运动推向以推翻段政府、建立国民政府为目标的斗争。区委发动北京各团体积极准备，并决定于11月28日开国民大会，逼段祺瑞下野。
