根据《中华人民共和国审计法》的规定，2016年8月至9月，审计署组织地方审计机关对基本医疗保险1和城乡居民大病保险等医疗保险基金进行了专项审计。审计抽查了28个省本级(含新疆生产建设兵团)、166个市本级和569个县(市、区)2015年和2016年上半年的基金管理使用情况，抽查资金金额3433.13亿元，延伸调查了3715个定点医疗机构、2002个定点零售药店以及其他相关单位。
根据医疗保险行政部门和经办机构提供的数据，截至2016年6月，审计地区基本医疗保险参保人数55 951.65万人;城乡居民大病保险参保人数36 797.79万人。2015年和2016年上半年，审计地区基本医疗保险基金收入12 692.81亿元，其中保险费收入12 280.12亿元;基金支出10 081.15亿元，其中基本医疗保险待遇支出9681.06亿元;期末基金累计结余9769.38亿元，其中统筹基金6602.95亿元，个人账户3166.43亿元。
审计结果表明，一是截至2016年6月，基本医疗保险制度覆盖全部审计地区，城乡居民大病保险基本实现全覆盖。审计地区2015年享受基本医疗保险待遇人次较2012年增长32.78%。部分地区已合并实施了统一的城乡居民基本医疗保险制度。总体上看，审计地区覆盖城乡的全民医保网已经建成，为实现人人病有所医提供了制度保障。
二是医疗保障能力稳步提高。2015年，审计地区基本医疗保险基金收入、支出、年末结余分别较2012年增长了57%、58%和68%，基金运行总体安全平稳。财政对居民基本医疗保险的投入不断加大，2015年各级财政投入补助资金和人均政府补助标准分别较2012年增长了67.69%和62.19%。2015年居民基本医疗保险住院费用政策内报销比例较2012年提高了1个百分点。城乡居民大病保险制度实施后，大病患者实际报销比例在基本医疗保险基础上提高了约12个百分点，群众就医负担进一步减轻。
三是医保服务管理不断完善。截至2016年6月，审计地区定点医疗机构和定点零售药店数量分别较2012年增长23.56%和63.76%;27个省已建成基本医疗保险的省内异地就医结算系统(平台)，审计地区2015年和2016年上半年共有577.87万人次通过省级平台即时结算异地就医费用362.15亿元，群众就医更加方便。超过6成的统筹地区开始实行按病种付费，探索建立医疗保险对医疗服务的引导约束机制。
