史书上虽然没有记载朱元璋具体哪一天死亡，但是对于出殡下葬的时间却记载很清楚，“辛卯（洪武三十一年闰五月十六日）即皇帝位，大赦天下，以明年为建文元年。是日，葬高皇帝于孝陵，诏行三年丧。”无论朱元璋是哪一天去世的，有一点已经成为如今史学界的共识，朱允炆在朱元璋死后没多久就将其安葬了，而且为了混淆视听还让南京城十三个城门大开，同时抬着棺材出殡掩人耳目，让人不知道朱元璋真正葬在哪里，这样反而对那些觊觎皇位的人震慑。
在南京民间流传一个说法，当年十三个城门抬出的棺材都是给朱元璋的殉人，朱元璋并没有葬在明孝陵，理由时据说当年孝陵每到深夜都会有妇人的哭声，原来这是马皇后的哭声，马皇后哭泣是因为自己独守一座孤坟的缘故。那么朱元璋到底葬在哪里呢？有人说葬在了北京的万岁山，清朝人赵执信在《万岁殿》记载，“明祖手持一杯酒，布衣刘季真吾友（太祖祭历代帝王庙，惟汉高祖前加酒一杯。理由是只有刘邦和他一样，是从个平民老百姓当上皇帝的，即‘惟公与我起布衣而有天下’一说），煤山万寿耸峥嵘，犹是因依万岁名。”
那么上面的说法真实性如何呢？目前没人哪位专家敢说是真的，也没有专家敢说朱元璋一定葬在了明孝陵里。
