显然，在金钱这块敲门砖前，水师官兵已放弃职责，开门揖盗，甚至不顾廉耻地为其保驾护航。这就是西方强盗能够在中国肆无忌惮地走私行销鸦片，使其毒害中国人民的罪恶勾当得逞的关键。受鸦片贩子金钱指使的清军官兵在外国人的眼里是没有丝毫战斗力的，他们认为如此腐败的军队实在不值得一击，甚至叫嚣一个团的英军就可以把数省的清军击溃。至於发生在国外的走私行为，对中国国家和军队的声誉更是极大的损害，如北洋海军舰船走私朝鲜人叁一案，曾招致朝鲜国王和官吏的不满，以致朝鲜国王下令严行查禁。连朝鲜海关总税务司也认为，这是件“对中国海军很不好看的事”。
清军从事商业活动，不管其范围多麽小，客观上都要对军队的建设和管绊理造成不良影响。从将领的任用上看，作为特殊的武装集团，军队用人应以熟悉军事业务为主要标准。但军队经商後，必然把善於经商，长於获利作为提拔部分将领的考核标准，甚至将一些所谓“经商奇才”请到军队里当官。胡雪岩和盛宣怀都是在这一背景下经办军队後勤部门的，并带来可观的经济利益而深得左宗棠、李鸿章的信任，受到重用。二人挪用军费办私人商业，累资巨万，也进一步加剧了军队中腐败现象的蔓延，影响了军队官兵的士气，从军事训练来看，经商活动的消极影响是巨大的。京营和驻防八旗士兵将大部分时间用来盘算如何做小生意，对日常操演是能躲就躲，或雇人顶替。绿营兵同样把主要精力用来自营生业，当然不会用心操练武艺，营中每逢会操，大都是雇人顶替。在这一背景下，严格的军事训练和检阅通常流於形式，若是奉旨阅兵的将领们真的要官兵们下场摆弄一下弓箭枪炮，便不时闹出“射箭，箭虚发;驰马，人堕地”的笑话来。
1834年冬，两广总督巡阅广东水师，令各营选送弓箭手、鸟枪兵前去检阅。各营派来的士兵仅占全营的十之三、四，理应是营中的武艺尖子，但一场考下来，连一枪一箭都不中者就有78人，仅中一枪一箭者有226人，军事技术大都十分生疏`。从武器装备的管理来看，经济利益的驱动使得某些利欲熏心的官兵千方百计挤占军用设施，许多八旗驻防部队将战马数量大大削弱，每年领取大量马粮草料，却腾出牧场来出租赚钱。有的将炮兵射击场也租出去。由於缺少场地和马匹，八旗官兵的训练次数大为减少，用鸟枪和火炮进行实弹射击的演习更少，如浙江旗、绿之营大量出租操场、牧场，以致各处校场皆不足一里，不但大炮，连抬炮(一种两人使用的简陋火器)射击也无法进行。
在晚清时期所建立的近代化军队北洋海军中，舰上军官也常常把发给他们用来买养护用品的钱，私扣归己，致使船舱机器擦抹不勤，零件损坏，大炮生锈。
中日甲午黄海海战中，北洋舰队一战即被击沉巡洋舰5艘，原因之一就是其平时战舰养护较差，水密门年久失修。从军队的管理来看，经商活动破坏了军队严格的纪律。终日当小商贩的清军士兵，不可能养成合格的军人素质，也无法用严格的军纪来约束他们。而军中将领经商，对破坏纪律、败坏风气的作用更大。
比如北洋海军章程规定，除提督外，各级军官都要终年住在舰上，不得上岸建公馆，但北洋海军提督丁汝昌为赚钱，自己首先破坏规定，在刘公岛上盖房子，出租给手下将领，获取租金，海军将领们从此纷纷上岸居住。“济远”舰管带方伯谦还特意在岛上盖起南方式样的房屋，租给福建籍将领住，抢了丁汝昌的生意，此事不仅使两人积怨日深，而且严重地损害了他们在军中的威信。
3、军队经商浪费了大量的军费和资金，破坏了正常的经济秩序`，阻碍了民族工商业的发展。清廷用军费和军队的人力、物力办企业，效益极差，浪费了资金和人力，物力资源。当时创建的铁路、电报等民用企业，一开始大都是由海军衙门等军事机构办的，经费也都来自军费，还大量使用士兵担任劳务和守卫之责。这类企业往往衙门气息浓重，生产不追求经济效益，致使企业亏损严重，清朝末年，这些企业实在维持不下去了，才陆续改成商办，按市场经济的要求来操作。
军工企业的产品虽然自身成本很高，但投入市场後，却具有很强的竞争力，对民用企业的产品造成严重威胁。这是因为军工企业借用军费当经营资本，不用付任何利息，又可以无偿使用军队劳力，其产品可以微利甚至无利销售，而不具备上述优惠条件的民办企业，显然无法与之公平竞争。
清末，中国民营企业生长缓慢，其中一个原因就是军办企业和官办企业破坏了正常的市场竞争秩序，使民营企业一出现便与军办企业和官办企业处於不平等的地位，个中教训是很值得後人回味的。
