1941年苏德战争爆发后，德军兵临莫斯科城下，战局对苏联十分不利，见风使舵的盛世才转而投靠蒋介石。1943年1月，国民党新疆省党部成立，国民党势力进入新疆。国民政府要盛世才向苏联驻迪化领事和军事顾问提出撤退红八团的要求。3月16日，盛世才借新疆省驻迪化部队春季检阅结束的机会，向苏联军事顾问团团长瓦西里也夫建议撤离红八团。1943年3月，苏联政府作出驻新疆部队撤离的决定，但直至11月4日才撤离完毕。
一个国家未经邻国中央政府许可，屡次出兵到邻国境内作战，又长期驻军，从国际法上说，这是严重的军事入侵行为。正因如此，苏联红军出兵消灭伊犁张培元部后，盛世才在给国民政府的报告中说伊犁张培元被仇人击毙，隐瞒了张兵败自杀的真相。1934年苏联红军击溃马仲英部后，盛世才给国民政府的电报中只提自己军队追剿，只字不提苏军参战一事。不仅如此，盛世才也不许新疆官民谈论此事。
