民国时期新疆首任省长兼督军是杨增新。从1912年到1928年，新疆在杨增新的控制下，基本保持了稳定。巴奇赤和阿连科夫率残部逃到塔城和伊犁时，杨增新采取灵活政策：一方面坚持收缴其武器，另一方面在指定地点对他们妥善安置，并尽量避免了苏俄红军越境追击。
后面内容更精彩 点击图片进入下一页白俄军人及难民生活困窘，一些白俄军官如巴奇赤、阿连科夫之流蠢蠢欲动，妄图把新疆作为其反共反苏的基地和后方。阿连科夫到迪化(1954年2月1日更名乌鲁木齐)后，与驻伊犁、塔城的白俄官兵相约，共同起事，夺取北疆。1921年1月，阿连科夫派手下华人祁海山到奇台县城侦察，结果被抓获，供出暴动计划。杨增新调兵将阿连科夫部包围，勒令缴械。阿连科夫被送往迪化软禁，1923年遣送内地时为冯玉祥部队扣留，引渡给苏联后被处死。
在苏俄红军和白军的内战中，一开始杨增新持中立态度，但以后形势的发展大大出乎杨的意料，特别是以巴奇赤为首的大批沙俄白匪军逃入塔城后兴风作浪，杨被迫改变了中立立场。但新疆兵力匮乏无法解除白匪军威胁，杨增新决定联合苏俄红军，共同消灭对新疆安全稳定威胁最大的巴奇赤白匪军。
