当时从政治意义、客观条件等方面考虑，将毛主席纪念堂建在天安门广场的意见自然地占了上风。因为天安门广场的历史发展久远，她曾是辽、金时代东北郊区的一座着名的古刹名寺，元大都时代的丽正门，明清时代的“T”型广场，她在中国都城演变历史中占有独特的一页。当新民主主义革命的熊熊火炬从天安门广场燃起，天安门广场成了一个新时代的标志。当共和国的五星红旗在天安门广场上升起，一个宏亮的声音“中国人民从此站起来了！”传遍神州大地的时候，天安门广场便成了举世闻名的广场。在天安门前的广场上，曾发生过许多次惊心动魄的事件，牵动亿万人的心弦，她是中华民族推翻顶戴花翎、王冠蟒袍，争取自由解放的见证；也是人民共和国开放改革和建设现代化的见证，每一个中国人都热爱天安门广场，她是中国人民心中的城！随着中国前进的步伐，天安门广场发生了翻天覆地的变化，谱写了新中国建设成就中最为辉煌的一页。广场通过整修、扩建，使其形成规模宏伟、布局严谨、气势壮观、建筑精美的独特艺术构图，这构图既凝聚了数千年的灿烂的中国文化，也体现了新中国的建筑的现代风格。天安门广场在建设速度上是值得称赞的。在西方城市史上，一个重要广场形成，往往经历了几十年、上百年，乃至上千年的岁月。而新中国在短短的近30年的历史内就建成了。她北起天安门红墙，南抵正阳门城楼，东始中国革命博物馆和中国历史博物馆，西至人民大会堂，南北长880米、东西宽500米，占地面积44万平方米，是全世界最大的广场。天安门广场，从新中国成立以后，就成了中国人民举行各种盛大集会的神圣重地，成了中华民族的象征。
正是出于这些，设计组同志认为:毛主席的伟大身躯，江湖河海容不下，三山五岳载不起，只有安卧在人民群众之中，才是最合适的地方。
11月6日，中央政治局听取纪念堂选址等问题的汇报后，作出了“毛主席纪念堂建在天安门广场人民英雄纪念碑南”的决定。
正阳门的存废问题地点定在纪念碑南侧，但具体位置设在哪里？当时提出了3个方案:一、纪念堂与纪念碑接近的方案，即纪念堂紧靠纪念碑。但这样设计，会使两个不同内容的纪念物形成一个整体，从而失去各自独立的政治含义。二、纪念堂位置偏南的方案，建议拆除正阳门，将纪念堂建在正阳门的位置上，意图是使纪念堂和天安门处于南北对称的位置，纪念碑恰似一座天平的支点。但这样布置，纪念堂受南面交通的干扰大。三、纪念堂紧靠正阳门。但这样，由于正阳门城楼高达42米，会有压倒纪念堂的感觉。
在三个方案争论之时，又出现了正阳门城楼的存废问题。这座北京仅存的保持完整的城楼古建筑，与天安门城楼南北遥遥相对，可以明确广场的南北界限，起到了丰富广场南面轮廓线的作用，而且它的存在可以使得纪念堂与交通稠密的前三门大街有所分隔，起到作为纪念堂南大门和“影壁”的作用。从门洞远眺纪念堂，仿佛是个画框，更会增加景深。这样，在决定不拆除正阳门的前提下，最后决定将纪念堂放在纪念碑与正阳门的正中。等距各200米，也就是原中华门的位置。
纪念堂的规格关于纪念堂的建筑形式，当年担任纪念堂工程设计小组领导成员的沈勃回亿道:“当时大家对毛主席十分怀念，认为只有宏大的建筑才能体现毛主席的伟大和崇高，设计都偏大。只有南京工学院杨庭宝提出的方案是50米见方的建筑。他的方案给人以很大的提示。最后，沈勃在众人意见的基础上，用了一整夜的时间，勾画出纪念堂实施方案草图。
