“重庆号”巡洋舰叛逃，国民党军当局起初不敢向蒋介石汇报。，最初数日，海军方面不断透过无线电台，呼叫“重庆号”舰长邓兆祥，劝其返回上海，但是，邓兆祥始终不予理会，继续朝北疾驰。从二月二十六日(星期六)到三月一日，国民党海军接连呼叫“重庆号”四天无效，这才决定向奉化溪口的蒋介石报告此一坏消息。
根据庋藏于台北“国史馆”的蒋介石大溪档案，《蒋公事略稿本》刊摘的蒋介石日记数据记载，蒋介石知悉“重庆号”叛逃北去，大为震怒：“民国三十八年三月二日……晚课后，获悉我海军重庆号巡洋舰为共匪煽动叛变，逃泊烟台港内，公以为此乃我海军之奇耻大辱，惟有将其炸沉，以免为匪利用。并判断该舰未逃往大连与旅顺港者，或因俄人以其目标太大，恐为我空军轰炸，致引起战衅之故欤？按重庆军舰原为英国所赠送，于上年五月十九日由我国派遣海军人员在波茨第茅斯接收，旋经新加坡、香港等地，驶抵我国上海。上月廿六日在长江下游出海演习，受共匪煽惑叛变，向北驶往共匪控制区域，经我海军电台一再呼喊，望其悔悟归来，未见效果，……。”
国共内战打到一九四九年三月初，蒋先生手上可打的牌已经越来越少，这节骨眼上，海军王牌“重庆号”又在解放军陈兵江北之际趁隙逃跑，这不啻使得蒋介石力抗解放军渡江的计划雪上添霜。“重庆号”除了硬件设施和吃水吨位上，属于国民党海军王牌中的王牌，该舰起义时，船上更载有大批物资、财宝、金条、银元。金银物资，原本是要作为海军撤退台湾后的经费。还有原存于南京国防部的海军与军方重要档案文件。这些舰载对象，被蒋介石视为不可见夺于中共的“命根子”。如今，”重庆号”竟然落到中共手里，叫天不应，叫地不灵，只有玉石俱焚一途。一九四九年三月二日，蒋介石透过长途电话，向南京空军副总司令王叔铭下达死命令，非把“重庆号”炸沉摧毁不可。
