三天后，朱棣登殿点将，命成国公朱能佩征夷将军印，为总兵官；西平侯沐晟佩征夷副将军印，为左副将军；新城侯张辅为右将军，丰城侯李彬为参将，云阳伯陈旭为右参将，统率大军八十万远征安南，兵部尚书刘俊参赞军务，都指挥同知程宽、指挥佥事朱贵为神机将军，都指挥同知毛八丹、朱广、指挥佥事王恕为游击将军，指挥同知鲁麟、都指挥佥事王玉、指挥使高鹏为横海将军，都督佥事吕毅、都指挥使朱英、都指挥使朱英、都指挥同知江浩、都指挥佥事方政为鹰杨将军，都指挥佥事朱英、都指挥同知金铭、都指挥佥事吴旺、都指挥同知刘塔出为骠骑将军。由这份名单可以看出，远征军将领多是随朱棣起兵“靖难”的功臣宿将。
成国公朱能是“靖难”武臣之首，朱棣藩封燕王时，与张玉共为王府指挥使，自东昌之役中张玉阵亡以来，朱能一直是朱棣的头号股肱之臣，南征北战、所向无敌，更是难得的帅才，“虽位列上公，却从未以富贵骄人”，深得军心，远征军其他将领也都是一时之选。
大军出发前，朱棣特颁谕旨，说明此次出征“惟黎氏父子及其同恶在必获，其胁从及无辜者必释，罪人既得，即择陈氏子孙之贤者立之，使抚治一方，然后还师，告成宗庙，扬功名于无穷。”
7月16日，远征军正式出师，朱棣亲往龙江饯行，这一天风和日丽，江面上百舸争流，旌旗蔽空，鼓角齐鸣，明军威武雄壮，军容之盛为开国以来所未有。
然而，意想不到的事情发生了，10月2日，南征军统帅朱能突然病逝于龙州，37岁的朱能正值年富力强，朱棣倚之甚重，不想此次“出师未捷身先死”，朱棣哀痛无比。朱能“勇决得士心”，他死后，军中一片哀哭。远征军箭在弦上，容不得任何拖延，年仅31岁的右将军张辅临危受命，主动承担起指挥全军的重任，他一面飞章奏报朱棣，一面率军南进，六天后，远征军由凭祥度坡垒关，进入安南境内。军情紧急，朱棣命张辅佩征夷将军印，充总兵官，代替朱能统率全军，并以明初常遇春病逝，副将李文忠建大功的事迹予以鼓励，希望张辅不负所托。
