对于以上事件，张作霖非但不加制止，反而责怪当地苏联公民不遵守东三省自治政府的法律法规。不仅如此，他还命令部下逮捕了中东铁路管理局局长伊万诺夫及有关人员。稍后，在张作霖唆使下，奉军采取了更大规模的行动，逮捕众多的苏方铁路员工，查抄并关闭与中东铁路有关的苏方办事、办公机构，把中东铁路的苏方人员一律撤换成清一色的奉系人员。
张作霖在中东铁路问题上的超常规举动震动了莫斯科的决策者。他们在把张作霖列为中国头号敌人的同时，开始了外交努力。联共(布)中央责成苏联外委会分别于1926年1月19日、21日致电北洋政府及东三省自治政府，要求采取必要的措施制止反苏事件，恢复中东铁路的正常秩序，释放被无理关押的苏方人员。此外，苏方还建议苏中、苏奉共同签署相关协议，以确保苏联公民在华及在中东铁路沿线地区的合法权益。
为防止事态进一步扩大，苏方还做出让步，即单方面撤消了原中东铁路管理局局长伊万诺夫的职务，并再次保证：今后一定使中东铁路变为纯粹的商业化企业。
由于双方的共同努力，关于中东铁路的冲突暂时平息。
1926年1月24日，在奉天举行了由苏联驻奉天总领事克拉科维茨基与东北代表签署有关文件的交换文本仪式。在仪式上双方签署了《苏联政府与中华民国东三省自治政府关于恢复中东铁路营运秩序》的文件。同日，张作霖命令释放在押的原中东铁路管理局局长伊万诺夫。第二天，与他同时被关押的其他苏方工作人员也被释放。
因中东铁路而引起的冲突似乎平息了，但是双方之间由此引发的仇视实际上更加强烈。
