然而1953年，74岁的斯大林逝世后，瓦西里根本没有足够的资历和能力接班，于是他惨遭高层的政治清算。搞掉他的不是别人，正是跟斯大林有杀子之仇的赫鲁晓夫。斯大林的两个儿子都是英勇的战士，而赫鲁晓夫对儿子列昂尼德的教育则非常失败。列昂尼德起先因酗酒杀死了一名苏军军官，不过因为父亲的原因，被网开一面从轻处理了。苏德战争爆发后，列昂尼德也成了德军战俘。在被俘期间，列昂尼德向德军透露了很多不该说的消息，回国后立马被判处叛国罪。赫鲁晓夫为了救儿子曾向斯大林下跪，无奈斯大林为了杀一儆百，最终还是把列昂尼德处决了。
两人就此结下了梁子，赫鲁晓夫也终于找到了报仇的机会。据记载，瓦西里被整得很惨。斯大林去世不久，他就被以“不抓军事训练，打人酗酒，滥用职权，贪污腐败”等多条罪状开除军籍，关入监狱；随后又被扣了“叛国反党，反社会主义，企图发动政变”的帽子，被流放到喀山一带。1962年3月19日，深受打击的瓦西里去世，官方称是病逝，不过历史学家们对此颇有争议。
斯大林还有一个女儿，名叫斯维特兰娜·阿利卢耶娃。她性格非常叛逆倔强，到处跟斯大林作对。甚至在16岁时，斯维特兰娜竟和一个比她大近20岁的犹太人谈起了恋爱。斯大林得知后非常生气，以间谍罪逮捕了那个犹太人。父女二人的矛盾开始日渐激化，斯维特兰娜改随母性，并于1967年以政治避难的名义逃到美国。1978年，斯维特兰娜直接加入美国国籍，并把心思放在研究美国历史上。这位“红色公主”最终在2011年因癌症病逝在美国，终年85岁。
别看斯大林一生大权在握，在苏联国内是绝对的权威。然而他亲手“害死”了自己的大儿子，因为私人恩怨连累了自己的小儿子，就连自己最疼爱的女儿都成了彻彻底底的美国人。有人说，是斯大林第一任妻子的病逝，带走了他性格中所有开朗、温和的一面，导致他后来成为铁腕甚至是有些残忍的“独裁者”。不过，在这位苏联伟人的影响下，他的亲生骨肉最终下场都带着浓重的悲剧色彩，难免不让人感到唏嘘。
