“文化大革命”进行到1967年11月时，刘少奇已经被扣上了“中国的赫鲁晓夫”、“党内最大的走资本主义道路的当权派”等大帽子。江青一手控制的中央专案组内的“刘少奇专案组”，正在以各种手段制造伪证，罗织罪名，要把刘少奇打成“叛徒、内奸、工贼”。这些已成定局，只是尚未履行组织手续罢了。
林彪、江青等人此时已把邓小平打成“党内第二号走资本主义道路的当权派”，阴谋置之于死地而后快。因此，毛泽东强调对邓小平要与刘少奇“区别一下”，这就极大地遏制了林彪、江青等人妄图彻底打倒邓小平的图谋。
1968年10月，中共八届十二中全会（扩大的）在北京召开。这次全会是在极不正常的情况下召开的。一些中央委员被剥夺了出席会议的权利，一些出席会议的中央委员在会上受到诽谤、诬陷和批判。（当时担任空军司令员的吴法宪，根据林彪的旨意，在全会小组会上当面诽谤朱德说：“朱总司令你在井冈山上怎样反对毛主席的，讲给我们听一听，教育我们。你当了一辈子总司令，实际指挥打仗的都是毛主席。因而你是个黑司令，不是红司令。”）原97名中共第八届中央委员除去世10人外，只有40人到会；从到会的19名候补中央委员里面挑选了10名，在会议的第一天补为中央委员，才刚刚超过全体中央委员的半数。出席会议的还有“中央文革小组”全体成员、中央军委办事组成员、各省市自治区革命委员会的主要负责人等74人。出席这次全会的人员共有133人，但其中中共第八届中央委员和候补中央委员仅有59人。就是在这种极不正常的情况下，全会通过了由江青、康生、谢富治等人凭伪证写成的《关于叛徒、内奸、工贼刘少奇罪行的审查报告》，决定把刘少奇永远开除党籍，撤销其党内外一切职务，从组织上完成了打倒刘少奇的手续。在这次全会上，林彪集团、江青集团还鼓噪要开除邓小平的党籍，由于毛泽东的反对而未能得逞。
在中共八届十二中全会上，毛泽东在讲话中两次提到了邓小平。
第一次是在中共八届十二中全会的开幕会上。毛泽东在讲话中说：“这次无产阶级文化大革命，对于巩固无产阶级专政，防止资本主义复辟，建设社会主义，是完全必要的，是非常及时的。文化大革命究竟要不要搞，成绩是主要的，还是缺点错误是主要的，要搞到底还是不搞到底，大家议一议。”鉴于林彪集团和江青集团在会上会下操纵煽动一批亲信骨干鼓噪，妄图造成一种要求开除邓小平党籍的形势，毛泽东明确地对邓小平问题表示了态度。毛泽东说：“邓小平在战争时期是打敌人的，历史上还未发现有什么问题，应与刘少奇区别对待，大家要开除（党籍），我有点保留。”正是由于毛泽东的这一决策，使邓小平得以保留了党籍，同时也为邓小平以后的复出准备了重要条件。
第二次是在中共八届十二中全会的闭幕会上。毛泽东主要是为一些被林彪集团、江青集团揪住不放的老同志说话。毛泽东说：“有些同志对于所谓‘二月逆流’这件事不大了解，经过十几天，就比较了解了。在这个全会上，由犯过错误的同志说明他们的问题，大家又对他们有些质问，他们再说明问题，又再质问，好像经过这么几次反复嘛，大家都比较清楚了。这件事嘛，要说小，就不那么小，是件大事。要说那么十分了不起呢，也没有什么十分了不起。他们有意见要说，几个人在一起，又都是政治局委员，又是副总理，有些是军委副主席，我看也是党内生活许可的。他们也是公开出来讲的。这个世界上面，总是左、中、右。统统是左派，我就不那么赞成。九大代表‘二月逆流’的同志们如果不参加，我看就是个缺点。陈毅同志，你就以那个右的那一方面的资格，以这个身份来参加九大。对于党内一些老同志，要一批二保三看。清理阶级队伍，注意一个‘准’字，不要搞‘逼供信’那一套。对于学术权威，注意不要做得太过分。冯友兰、翦伯赞可能还有某种用处。批是要批的，保还是要保的。邓，大家要开除，我有点保留，他和刘还有点区别。‘多中心’不对。”
毛泽东在这两次讲话中，首先对邓小平在长期革命战争中的巨大历史贡献给予了充分肯定：邓小平在战争时期是打敌人的；其次是对邓小平的革命斗争历史进行了充分肯定：邓小平历史上还未发现有什么问题；再次是坚持把邓小平留在党内，不能像对待刘少奇那样“开除党籍”。
中共八届十二中全会闭幕以后，筹备召开中国共产党第九次全国代表大会的工作正式列入议事日程，各项准备工作相继展开。起草中共九大的政治报告，是准备工作中的一件大事。为了争夺政治报告的起草权，陈伯达与张春桥、姚文元之间又进行了一番激烈的争斗。最后陈伯达与康生、张春桥、姚文元（张、姚执笔）各起草了一份政治报告。后经中央讨论，林彪在九大上宣读的是由康生、张春桥、姚文元起草的那份政治报告。
在陈伯达最初起草的政治报告文稿上，曾经写有“刘、邓路线”的话，毛泽东否定了陈伯达的这种提法。
据陈伯达生前回忆，“‘九大’前，原来决定要我和张春桥、姚文元共同起草政治报告稿。我不愿同张、姚等人合作。起草人名单上，是我列在前面。我就自己着手，并组织几个人帮助搞材料。在我起草的稿子上，我写过关于‘刘、邓路线’的话。毛主席看过，说了一个重要指示：‘邓小平同志打过仗，同刘少奇不一样，报告上不要提他。’”
