毛主席纪念堂建设施工照
正阳门的存废问题地点定在纪念碑南侧，但具体位置设在哪里？当时提出了3个方案:一、纪念堂与纪念碑接近的方案，即纪念堂紧靠纪念碑。但这样设计，会使两个不同内容的纪念物形成一个整体，从而失去各自独立的政治含义。二、纪念堂位置偏南的方案，建议拆除正阳门，将纪念堂建在正阳门的位置上，意图是使纪念堂和天安门处于南北对称的位置，纪念碑恰似一座天平的支点。但这样布置，纪念堂受南面交通的干扰大。三、纪念堂紧靠正阳门。但这样，由于正阳门城楼高达42米，会有压倒纪念堂的感觉。
在三个方案争论之时，又出现了正阳门城楼的存废问题。这座北京仅存的保持完整的城楼古建筑，与天安门城楼南北遥遥相对，可以明确广场的南北界限，起到了丰富广场南面轮廓线的作用，而且它的存在可以使得纪念堂与交通稠密的前三门大街有所分隔，起到作为纪念堂南大门和“影壁”的作用。从门洞远眺纪念堂，仿佛是个画框，更会增加景深。这样，在决定不拆除正阳门的前提下，最后决定将纪念堂放在纪念碑与正阳门的正中。等距各200米，也就是原中华门的位置。
纪念堂的规格关于纪念堂的建筑形式，当年担任纪念堂工程设计小组领导成员的沈勃回亿道:“当时大家对毛主席十分怀念，认为只有宏大的建筑才能体现毛主席的伟大和崇高，设计都偏大。只有南京工学院杨庭宝提出的方案是50米见方的建筑。他的方案给人以很大的提示。最后，沈勃在众人意见的基础上，用了一整夜的时间，勾画出纪念堂实施方案草图。
