从现存的大量资料看，肖劲光等海军领导对林彪的某些观点、行为有自己的看法，“跟得不紧”（准确说是“不很紧”）是事实，但这绝非他们刻意抵制，而是由海军部队的特点和实际情况决定的。海军是新创建的高技术军种。部队官兵大部分来自陆军部队，且文化水平偏低。当时沿海战斗任务频繁，军舰要出海，飞机要上天，没有系统的专业技术训练是万万不行的。而海上、空中训练受自然气候的制约，有时难免对政治学习、军事训练时间作点调整。所以，林彪主持军委日常工作不久便发现海军“军政位置摆得不正”。林彪得出结论：根本原因在于偌大海军没有“自己的人”。一天，他颇有感慨地对身边的一个亲信说：三军少了一军不行，如果少一军，就可能出大问题。
当时海军的政治委员是苏振华。林彪经过一段时间观察，发现苏振华工作积极、负责，也有建树，但是“不很听话”。具体说，就是苏振华不仅听他的，也听贺龙（中央军委副主席）、罗荣桓（军委常委、总政治部主任）的。这使林彪心里不是滋味。一次，听取海军的工作汇报后，林彪特别强调:“就按我刚才说的搞，别的都不要听！”苏振华调海军任职是由彭德怀提名、邓小平同意的，据此，林彪又认为苏振华很难成为“自己人”。
时任海军司令员的肖劲光，在东北战场上曾与林彪共蹈战火三年多。肖到海军任职虽非林彪推荐，却也是经他同意的。按说，这应该算“自己人”了。但林彪清楚，肖劲光很有自己的见解，不轻易听命于人。加之肖劲光年龄比他大，资历比他深（林彪进入黄埔军校时，肖劲光已留苏归来，就任国民革命军中将、师党代表），且与毛泽东有特殊的关系，指挥起来也不是“很方便”。
基于此，林彪开始考虑逐步削弱肖劲光等人的权力，安插“自己的人”。第一个大的动作，即于1962年初向海军派出了庞大的“军委检查团”。
1959年至1961年，是三年大饥荒时期。在这前后，海军东海舰队在训练中连续出了飞行员叛逃、潜艇沉没等几个重大事故。这些事故的产生有管理上的原因，也有经验不足的问题，与当时经济困难、思想混乱的大环境也有很大关系。这样的问题海军部队有，其他大单位也有。对同时发生问题的其他大单位，林彪视而不见，却抓住东海舰队大做文章。
军委检查团是1962年4月2日派出的，以杨成武副总参谋长为团长，由总参军训部长李作鹏、总政组织部副部长张秀川等41人组成。检查内容，最初说是检查政治思想工作，但很快就说不清楚了，最后上纲上线地对海军问题作结论：“海军存在的最本质问题是：毛泽东思想红旗举得不高，‘四个第一’没有真正摆在第一位，在海军党委的指导思想上存在着单纯军事观点的偏向。”4月底，林彪在军委装备会上长篇发言，据此对海军的工作进行了严厉批评，指责海军“放着现成的药方子不用，另找药方子”，“懒婆娘管家，管得稀稀拉拉、乱七八糟”。（后来被称为“林副主席对海军工作的三点指示”）军委检查团工作结束后，林彪以加强海军领导为名把李作鹏和张秀川留在海军，分别担任了海军副司令员和海军政治部主任。
