（三）蒙古统治时期
1229年，窝阔台（铁木真第三子）即汗位后，将甘肃、青海和宁夏，作为封地划归他的第二子阔端。阔端于1240年从凉州（武威）派大将多塔纳波率军攻入西藏，进驻热振、澎波地区。多塔建议迎请萨迦派高僧萨班贡噶坚赞去凉州洽商有关西藏事宜，于是1244年阔端召请萨班，萨班于1246年到达凉州，次年，萨班贡噶坚赞携其两侄八思巴和恰那多吉一起与阔端见面。这样，萨班就代表西藏地方势力和蒙古王室建立了直接联系。阔端与萨班议定了西藏归顺蒙古汗国的具体条件：蒙古任用萨迦派藏人为达鲁花赤（地方行政长官），并赐于蒙古金符，吐蕃各地头人必须听命萨迦的金符；吐蕃各地缮写官吏、户口、贡赋清册三份，分别交给各地官吏、阔端和萨迦；蒙古将派官员到卫藏，会同萨迦人员议定税目。
蒙古汗国（后来发展为元朝），认定了萨迦教派在西藏的领袖地位，萨迦人员被授予治理卫、藏、阿里的全权，政教合一的萨迦地方政权对西藏的统治即由此开始。同时蒙古有实效地占有了西藏。
1251年，蒙哥即汗位，原属阔端领地的西藏，由阔端改归忽必烈统管。1252年忽必烈南征云南途经金沙江以东藏族地区时，卫藏各地方势力再次向蒙古汗国表示归顺。忽必烈召见萨迦教派新首领八思巴并留侍左右，认定八思巴为其统治西藏的代理人。
公元1260年忽必烈即大汗位，封八思巴为国师。1264年忽必烈自上都迁都大都，设立掌管全国佛教事务的总制院，八思巴以国师身份兼管总制院院务，同时总制院又是吐蕃省省长。1288年，总制院改名宣政院，同枢密院、中书省、御史台并列，是皇帝直接控制下的元朝中央四大机构之一。八思巴的弟子桑哥，通晓藏、汉、蒙、回几种语言，任尚书右丞相，是为元朝中一位职位极高的藏族大官。
宣政院主管的吐蕃省被蒙古皇帝划分为吐蕃等处、吐蕃等路、乌思藏三个路，省长、路长、万户都由藏族提名，皇帝委任。元朝常派军队驻扎西藏，并在各地设立15个驿站，沿途居民逐站负责出动马匹，传送公文，供应来往官员食宿，由此形成了西藏地方的乌拉制度。
忽必烈派儿子那木罕驻阿力麻里（霍城），建阿力麻里省，统辖伊犁地区；1281年，在别失八里省之下设置了别失八里（吉木萨尔）、哈喇火州（吐鲁番）、斡端三个路，统管南、北疆的政务；新疆也成了元帝国的一部分。1306年，笃哇恢复蒙古察合台汗国，蒙古元朝在新疆中亚的统治终结。
总的说来，西藏成了蒙古人统治的一个区域，但就当时的情形而言。西藏和中国都是蒙古的殖民地，中国人和西藏人同为一个主子的亡国奴，并且西藏人的地位高于中国人。西藏并没有属于中国。历史之家（www.lszj.com）
