但是，苏联外交上一贯的霸道干预和控制，使达乌德非常不满。从1975年开始，达乌德清洗亲苏势力，并向苏联以外的世界寻求援助。1977年2月，阿富汗通过共和国宪法。根据宪法筹建的民族革命党成为唯一合法政党，亲苏的“旗帜派”分子被彻底清洗出政府和军队。
很快，苏联进行报复。1978年4月27日，人民派和旗帜派的军官联合发动军事政变，苏联飞行员驾机直接参加进攻总统府的战斗。次日，总统府被攻占，达乌德以身殉职，阿富汗政权再次更迭。政变后，表面上，人民派虽然和旗帜派一样完全倒向了苏方，实际上，人民派领导人很快展开对旗帜派的清洗。
最后，亲苏方的旗帜派领导人塔拉基和人民派领导人阿明矛盾激化。1979年9月14日，塔拉基暗杀阿明不成，反被阿明反手一击。9月16日，阿明政变成功，公开强烈表示对苏联的不满。
接着，苏联再次报复。1979年12月27日，在苏联的支持下，塔拉基政权时期担任阿富汗革命委员会副主席和副总理的巴布拉克·卡尔迈勒发动政变，推翻哈菲祖拉·阿明政权。这次政变，实际上是在苏军的直接参与下完成的。1979年12月24～26日，苏联出动200架次大型运输机，突击向阿富汗首都喀布尔运送5000多人的军队、300辆装甲车和几十辆坦克，苏联驻喀布尔地区的部队增加到近1个师的兵力，这些部队控制了喀布尔空军基地和各个军事要地。与此同时，在与阿富汗接壤的苏联边境地区，还有5个师处于集结待命状态。12月30日，据报道，苏联在阿富汗的军队已经增加到万～3万人。
苏军入侵阿富汗，遭到世界各国的一致谴责。美国、北约、伊斯兰国家认为，这是苏联为谋求私利和打破已有的战略力量平衡的直接尝试。
1979年12月28日，时任美国总统吉米·卡特发表声明：“苏联军队进入阿富汗是对和平明目张胆的威胁，它可能标志着我们双边关系根本和长期的变更。”卡特要求苏联立即撤军，并停止干涉阿富汗内政。两天后的1979年12月30日，中国政府发表声明，强烈谴责苏联的霸权主义行径，坚决要求苏联停止对阿富汗内政的干涉，撤出一切武装部队。1980年1月6日晚，邓小平在宴请来访的时任埃及副总统的穆巴拉克时说：“最近，苏联悍然派兵大规模入侵阿富汗，粗暴地干涉其内政，严重地威胁着亚洲和世界的和平与安全。苏联这一行动，是它为谋求世界霸权而采取的一个重要步骤。”1980年1月7日，孟加拉国、牙买加、尼日尔、菲律宾、赞比亚五个不结盟组织理事国，代表世界上50多个不结盟国家，向联合国安理会递交不结盟国家通过的关于阿富汗局势的决议草案，要求尊重阿富汗的主权、领土完整、独立和不结盟地位，并立即无条件从阿富汗撤走一切外国军队。
